Nu sunt federalist, pentru că nu am depus niciodată întregul sistem al opiniilor mele la crezul vreunui partid al bărbaților. . . . O astfel de dependență este ultima degradare a unui agent liber și moral. Dacă nu aș putea merge la cer, dar cu o petrecere, nu aș merge deloc acolo.
(I am not a Federalist, because I never submitted the whole system of my opinions to the creed of any party of men whatever. . . . Such an addiction is the last degredation of a free and moral agent. If I could not go to heaven but with a party, I would not go there at all.)
în cartea sa „American Sfinx: personajul lui Thomas Jefferson”, Joseph J. Ellis explorează individualitatea puternică a lui Jefferson și angajamentul de neclintit față de credințele sale personale. Respingerea lui Jefferson a federalismului evidențiază disprețul său pentru respectarea dogmatică la orice partid sau sistem politic. El a crezut că alinierea completă cu un partid compromite libertatea și autonomia morală, pe care o considera degradantă.
Perspectiva lui Jefferson reflectă părerea lui că adevărata libertate implică capacitatea de a gândi independent și de a menține integritatea personală, chiar și în problemele politice. El a declarat faimos că, dacă unirea unei părți ar fi o cerință pentru ascensiunea spirituală, el ar prefera să o evite cu totul. Această convingere își subliniază credința în importanța gândirii individuale și a pericolelor conformității politice, pe care le-a văzut ca fiind dăunătoare atât pentru bunăstarea personală, cât și pentru cea socială.