Ik ben geen federalist, omdat ik nooit het hele systeem van mijn meningen heb ingediend bij het credo van een partij van mannen, wat dan ook. . . . Een dergelijke verslaving is de laatste degradatie van een vrije en morele agent. Als ik niet naar de hemel kon gaan, maar met een feestje, zou ik daar helemaal niet heen gaan.
(I am not a Federalist, because I never submitted the whole system of my opinions to the creed of any party of men whatever. . . . Such an addiction is the last degredation of a free and moral agent. If I could not go to heaven but with a party, I would not go there at all.)
In zijn boek "American Sphinx: The Character of Thomas Jefferson," onderzoekt Joseph J. Ellis de sterke individualiteit van Jefferson en niet aflatende toewijding aan zijn persoonlijke overtuigingen. Jefferson's afwijzing van het federalisme benadrukt zijn minachting voor dogmatische naleving van een politieke partij of systeem. Hij geloofde dat het volledig afstemmen van zichzelf met een partij de vrijheid en morele autonomie in gevaar brengt, die hij beschouwde als vernederend.
Het perspectief van Jefferson weerspiegelt zijn mening dat ware vrijheid het vermogen inhoudt om onafhankelijk te denken en persoonlijke integriteit te behouden, zelfs in politieke zaken. Hij verklaarde beroemd dat als hij bij een partij zou komen een vereiste was voor spirituele beklimming, hij het liever zou vermijden. Deze overtuiging onderstreept zijn geloof in het belang van individuele denken en de gevaren van politieke conformiteit, die hij beschouwde als schadelijk voor zowel persoonlijk als maatschappelijk welzijn.